2016 m. rugsėjo 21 d. Lietuvos Respublikos Vyriausybės nutarimu Nr. 937 buvo patvirtinto Vystomojo bendradarbiavimo tarpinstitucinio veiklos plano 2017–2019 metams 14 straipsnis numato tolimesnį Lietuvos valstybės ir savivaldybės institucijų dalyvavimo ES Dvynių programoje skatinimą.
2016 m. lapkričio 3 d. patvirtinta Lietuvos vystomojo bendradarbiavimo ir humanitarinės pagalbos įstatymo nauja redakcija, kurios 12 straipsnis apibrėžia valstybės ir savivaldynių institucijų ir įstaigų darbuotojų dalyvavimo vystomojo bendradarbiavimo projektuose darbo užmokesčio mokėjimą ir grąžinimą į pareigas.
Su ES Dvynių programos projektų įgyvendinimu susiję pakeitimai Valstybės tarnybos įstatyme:
- 4 str. Įstatymo taikymas valstybiniams tarnautojams išskyrus statutinius
- 16 str. 2 d. e) dėl darbo užmokesčio projektų įgyvendinimo metu, jei nemokamas atlyginimas iš biudžeto lėšų
- 161 str. 3) Valstybės tarnautojų teisė dirbti kitą darbą ES finansuojamuose projektuose
- 23 str. 3) darbo užmokestis už darbo projektuose laiką
- 381 str. atostogos dėl dalyvavimo ES finansuojamuose paramos teikimo projektuose
- 42 str. tarnybos stažas nenutrūksta projekto ir jo atostogų metu
- 43 str. 8) eitų pareigų garantavimas
Kiti taikytini Valstybės tarnybos įstatymo straipsniai:
- 8 str. 5 d. į didžiausią leistiną pareigybių skaičių nereikia atsižvelgti įstaigoje steigiant pareigybes vykdyti projektams iš ES finansinės paramos (išskyrus techninę paramą)
- 15 str. 11 d. teisė dirbti kitą darbą
- 24 str. 4 d., 5 d. darbo užmokesčio už ne visą darbo dieną ir už papildomą darbą apskaita
- 26 str. priemokos
- 26 str.1 d. 1 p. priemokų mokėjimas valstybės tarnautojams, dirbantiems projekte, atliekant pareigybės aprašyme nustatytas funkcijas
- 26 str.1 d. 2 p. priemokų mokėjimas valstybės tarnautojams, dirbantiems projekte, kai pareigybės aprašyme nenumatytos su projekto vykdymu susijusios funkcijos
- 26 str. 3 d. kai papildomas darbas dirbamas ilgiau nei 1 metus, tikslintini struktūrinio padalinio uždaviniai ir funkcijos, kaip numatyta 43 str. 12 d.
Lietuvos Respublikos Darbo kodeksas:
- 144 str. 5 d. darbo laiko trukmės reikalavimai – darbo dienos trukmė ne ilgesnė nei 12 val.
- 146 str. 1.1 d. ir 3 d. ne viso darbo laiko nustatymo suteikimo tvarka ir darbuotojo teisės
- 160 str. minimalūs paros poilsio laiko reikalavimai
- 161 str. minimalūs savaitės poilsio laiko reikalavimai
- Vyriausybės nutarimas 2003 m. rugpjūčio 7 d. Nr. 990 2.7 p. dėl atskiro darbo grafiko sudarymo
- Vyriausybės nutarimas 2004 m. lapkričio 29 d. Nr. 1508 ne viso darbo laiko nustatymo suteikimo tvarka
- Vyriausybės nutarimas 2006 m. liepos 24 d. Nr. 741 valstybės tarnautojų prašymų leisti dirbti kitą darbą pateikimo ir nagrinėjimo tvarka
- Vyriausybės nutarimas 2010 m. vasario 10 d. dėl nutarimo Nr.990 pakeitimo
- Vyriausybės nutarimas 2010 m. balandžio 7 d. dėl Lietuvos Respublikos Vyriausybės 2002 m. rugpjūčio 10 d. nutarimo Nr. 1255 "Dėl Lietuvos Respublikos valdininkų registro reorganizavimo į Valstybės tarnautojų registrą ir Valstybės tarnautojų registro nuostatų patvirtinimo" pakeitimo"
Dėl komandiruočių Projektų įgyvendinimo metu tvarkos daryti Vyriausybės nutarimo 2004 m. balandžio 29 d. Nr. 526 "Dėl tarnybinių komandiruočių išlaidų apmokėjimo įstaigose taisyklių patvirtinimo" pakeitimai:
- Vyriausybės nutarimas 2009 m. rugsėjo 23 d. Nr.1150,
- 2.2 p. iš ES lėšų apmokamoms komandiruotėms yra taikomos atitinkamo projekto nustatytos sąlygos;
- 2.3 p. tokių komandiruočių trukmė gali būti ilgesnė, nei 30 kalendorinių dienų
- Vyriausybės nutarimas 2012 m. rugsėjo 2 d. Nr.116
- Komandiruočių sąnaudų atskaitymo iš pajamų taisyklės netaikomos iš ES lėšų finansuojamiems projektams